第4题：

　　李明，系某国有宏大股份有限公司董事长，省、市两级人民代表大会代表;张旭，系某国有宏大股份有限公司总经理。2006年2月，某市检察院收到一封检举信，揭露该公司偷税800万元的事实。检察院经调查后，认为该公司确有偷税事实，依法应追究刑事责任，于是经该市检察院批准对该公司立案侦查。立案后，于2006年7月25日报请批捕。2006年8月6日，该市检察院批准逮捕李明、张旭，并派该检察院反贪局工作人员将二人逮捕。2006年8月14日，张旭聘请的律师向检察院申请取保候审，检察院提出缴纳10万元保证金，并提供保证人。后经侦查发现，该公司于2004年到2006年间，共偷税漏税600万元。该市检察院冻结该了该公司帐户，并将600万元作为税款上交国库。该案于2007年3月15日向该市中级人民法院提起公诉。在一审中，公诉人对被告人李明、张旭同时进行了讯问。在法庭调查中，公诉人发现李明有受贿和贪污犯罪事实，当庭提出要求撤回起诉，合议庭审查后作出撤回起诉的决定。重新起诉后，经法庭审理，认为该公司的行为已构成偷税罪，李明的行为已构成受贿罪和贪污罪，遂判决被告人李明有期徒刑十年，并处罚金10万元，张旭有期徒刑七年，并判处罚金5万元;对该公司判处1000万元的罚金。判决后，该市检察院认为一审法院对被告人李明、张旭量刑过轻，直接向该省高级人民法院提交抗诉书，提起抗诉。该省高级人民法院在二审中经书面审理，认为一审法院认定事实清楚，证据确凿，但量刑过轻，遂裁定撤销原判，改判处被告人李明无期徒刑，张旭有期徒刑十五年。

　　问题：

　　⑴该案中人民检察院有哪些程序不合法，为什么?

　　⑵该案中，两级法院有哪些程序不合法，为什么?

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